O Omnitrix foi originalmente inventado por um Galvan chamado Azmuth, que é um dos seres mais inteligentes que existem. Ben Tennyson recebeu pela primeira vez o Omnitrix quando ele tinha 10 anos e, no começo, ele só podia acessar 10 formas alienígenas.

Em Ben 10 Omniverse, Ben empunha uma versão mais recente do Omnitrix, Azmuth revela como o Omnitrix original ainda era apenas um protótipo. Usando este novo Omnitrix, Ben se transformou em dezenas de aliens, novos e velhos, e ele está sempre descobrindo novas formas.

Na mesma época, o gênio do mal Dr. Psychobos inventou uma imitação do Omnitrix chamado Nemetrix. Ele permite que o cão de Khyber se transforme nos predadores naturais dos aliens do Omnitrix de Ben, dando a Khyber a vantagem na maioria das situações.